Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc175E9PVB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms