Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim5E9PV98 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms