Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FgaE9PV24 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FgaE9PV24 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms