Protein–RNA interactions for Protein: E5FYH1

Topaz1, Testis- and ovary-specific PAZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topaz1E5FYH1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Topaz1E5FYH1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Topaz1E5FYH1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Topaz1E5FYH1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms