Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930558K02RikE0CXC6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms