Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms