Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500009C09RikD3YYW9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms