Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms