Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30cD3YVI9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30cD3YVI9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms