Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3259D3YUK0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms