Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx8D3YU81 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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