Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf11cB4XVP9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11cB4XVP9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms