Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pnldc1B2RXZ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms