Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia1B2RXQ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms