Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr3aB2RXC6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr3aB2RXC6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms