Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc11B2RXC1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms