Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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