Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc22a28B2RT89 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms