Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrn3B2RS91 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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