Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf518bB2RRE4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms