Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms