Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms