Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtpruB1AUH1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms