Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm438B1ASB3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms