Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfkfb3A7UAK5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfkfb3A7UAK5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pfkfb3A7UAK5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms