Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xlr4aA2BI40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xlr4aA2BI40 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms