Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef17A2ASJ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef17A2ASJ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms