Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr4A2ARI4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lgr4A2ARI4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lgr4A2ARI4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms