Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms