Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GabreA2AMW3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GabreA2AMW3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms