Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef6A2A8M8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef6A2A8M8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef6A2A8M8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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