Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbf1A2A870 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms