Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb4A2A863 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms