Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsg1A2A825 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsg1A2A825 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsg1A2A825 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms