Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm2A2A7B5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm2A2A7B5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms