Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms