Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1lA2A5N3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms