Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms