Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUM8

Gm45140, Predicted gene 45140, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45140A0A0N4SUM8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45140A0A0N4SUM8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm45140A0A0N4SUM8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45140A0A0N4SUM8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms