Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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