Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm28919A0A087WP35 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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