Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms