Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms