Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms