Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms