Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sema6cQ9WTM3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms