Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.8 ms