Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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