Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm11565-201ENSMUST00000105053 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Rpl15-ps4-201ENSMUST00000122372 606 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm27195-201ENSMUST00000184283 681 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crim1Q9JLL0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms