Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tlr5Q9JLF7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms